El cost de construcció i els costos-operatius a llarg termini de les cases de contenidors sempre han estat una preocupació important. Els investigadors, mitjançant càlculs exhaustius del cost total dels diferents materials d'aïllament durant tota la seva vida útil, van descobrir alguns fenòmens interessants: si bé es necessiten capes d'aïllament més gruixudes a les zones d'alt-altitud, això no significa necessàriament una major rendibilitat de costos-. Alguns materials d'aïllament d'alta-tecnologia (com els panells de buit d'aerogel), malgrat el seu excel·lent rendiment d'aïllament, són difícils d'adoptar àmpliament a causa del seu preu elevat.
Cal destacar que l'optimització del disseny mitjançant mètodes de càlcul científic no només pot reduir els costos inicials de construcció, sinó també reduir significativament les despeses de consum d'energia posteriors. Aquest enfocament d'optimització integral fa que les cases de contenidors siguin més competitives pel que fa a la rendibilitat-de costos, proporcionant un fort suport per a la seva adopció generalitzada. Aquestes troballes proporcionen referències pràctiques per al disseny econòmic de cases de contenidors-tenint en compte tant la inversió inicial com el càlcul acurat dels-costos operatius a llarg termini.